Kolekcje tematyczne i środowiskowe – zbiory materiałów archiwalnych uporządkowanych wg tematu (np. Czerwiec 1976, Marzec 1968, Internowania) lub środowiska, organizacji, która je wytwarzała (np. Komitet Obrony Robotników, Prymasowski Komitet Pomocy Osobom Pozbawionym Wolności i ich Rodzinom). Sygnatury w Archiwum Opozycji: F – kolekcja Stowarzyszenia Federacji Młodzieży Walczącej, A – dla kolekcji „Solidarność – narodziny ruchu” oraz AO IV dla pozostałych kolekcji tematycznych i środowiskowych.